装有苹果酒或其他饮料的瓶子很快就会浸入热水中。这种巴氏杀菌机的优点是，在巴氏杀菌过程中，瓶子也能从外部得到很好的清洗。

将灌装好的瓶子和密封好的瓶子放入不锈钢柜内，通过数字控制面板可对温度等级和持续时间进行编程，加热时间和冷却时间均可调节。

饮料流经带有几个热交换器的巴氏杀菌系统。饮料在装瓶前在管道中连续进行巴氏杀菌。